Od začiatku pandémie zohrávalo diagnostické testovanie zásadnú úlohu pri kontrole šírenia SARS-CoV-2, vírusu, ktorý spôsobujeCOVID-19.Rýchle antigénové testyvykonávané doma alebo v klinickom prostredí poskytujú výsledky za 15 minút alebo menej.Čím skôr je človek diagnostikovaný, tým skôr môže vyhľadať lekársku pomoc a izolovať sa od ostatných.Ale keď sa objavia nové varianty vírusu, tieto varianty nemusia byť detekované týmito testami.
Väčšina rýchlych antigénových testov je navrhnutá na detekciu nukleokapsidového proteínu alebo N-proteínu SARS-CoV-2.Tento proteín sa nachádza v hojnom množstve vo vírusových časticiach a infikovaných ľuďoch.Súprava na rýchly testzvyčajne obsahujú dve rôzne diagnostické protilátky, ktoré sa viažu na rôzne časti proteínu N.Keď sa protilátka naviaže na proteín N vo vzorke, na testovacej súprave sa objaví farebná čiara alebo iný signál, čo naznačuje infekciu.
Proteín N pozostáva zo 419 aminokyselinových štruktúrnych jednotiek.Ktorákoľvek z nich môže byť mutáciou nahradená inou aminokyselinou.Výskumná skupina vedená Ph.D.Philip Frank a Eric Ortlund z Emory University sa rozhodli preskúmať, ako táto zmena jednej aminokyseliny ovplyvňuje výkon rýchleho antigénneho testu.Použili techniku ​​nazývanú skenovanie hlbokých mutácií, aby súčasne zhodnotili, ako každá mutácia v proteíne N vírusu ovplyvňuje väzbu na diagnostickú protilátku.Ich výsledky boli publikované v Cell 15. septembra 2022.
Výskumníci vytvorili komplexnú knižnicu takmer 8 000 mutácií proteínov N.Tieto varianty predstavujú viac ako 99,5 % všetkých možných mutácií.Potom vyhodnotili, ako každý variant interagoval so 17 rôznymi diagnostickými protilátkami používanými v 11 komerčne dostupných rýchlych antigénových testoch, vrátane bežnýchdomáce súpravy.
Tím zhodnotil, ktoré mutácie N-proteínu ovplyvňujú rozpoznávanie protilátok.Na základe týchto informácií vytvorili „profil únikovej mutácie“ pre každú diagnostickú protilátku.Tento profil identifikuje špecifické mutácie v proteíne N, ktoré môžu ovplyvniť schopnosť protilátky viazať sa na svoj cieľ.Analýza ukázala, že protilátky používané v dnešných rýchlych testoch rozpoznávajú a viažu všetky minulé a súčasné varianty SARS-CoV-2, ktoré vyvolávajú obavy a obavy.
Hoci niekoľko diagnostických protilátok rozpoznáva rovnakú oblasť proteínu N, vedci zistili, že každá protilátka má jedinečný podpis únikových mutácií.Keďže vírus SARS-CoV-2 naďalej mutuje a vytvára nové varianty, tieto údaje možno použiť na označenie protilátok testovacej súpravy, ktoré možno bude potrebné prehodnotiť.
„Presná a efektívna identifikácia infikovaných jedincov zostáva kritickou stratégiou na zmiernenie ochorenia COVID-19 a naša štúdia poskytuje informácie o budúcich mutáciách SARS-CoV-2, ktoré by mohli interferovať s detekciou,“ povedal Ortlund."Tu načrtnuté výsledky nám umožňujú rýchlo sa prispôsobiť tomuto vírusu, pretože sa stále objavujú nové varianty, ktoré predstavujú okamžité klinické dôsledky a dôsledky pre verejné zdravie."
Pozadie: Mutation Deep Scan zisťuje únikové mutácie v nukleokapside SARS-CoV-2 pomocou v súčasnosti dostupných rýchlych antigénových testov.Frank F., Kin MM, Rao A., Bassit L., Liu H, Bowers HB, Patel AB, Kato ML, Sullivan JA, Greenleaf M., Piantadosi A., Lam VA, Hudson VH, Ortlund EA cell.2022 15. septembra;185(19):3603-3616.e13.Ministerstvo vnútra: 10.1016/j.cell.2022.08.010.29. augusta 2022 PMID: 36084631.
Financovanie: Národný inštitút pre biomedicínske zobrazovanie a bioinžinierstvo NIH (NIBIB), Národný inštitút pre diabetes, trávenie a ochorenia obličiek (NIDDK) a Národný inštitút pre alergie a infekčné choroby (NIAID), American Heart Association.
NIH Research Matters je týždenná aktualizácia kľúčových zistení výskumu NIH, ktoré preskúmali experti NIH.Zverejňuje ho kancelária pre komunikáciu a verejné záležitosti riaditeľa Štátnych zdravotných ústavov.